http://perso.estat.com/cgi-bin/perso/14801226519?page=DEAMIA

Master MATHEMATIQUES / VISION / APPRENTISSAGE 2014/2015  

Modeles Deformables de Courbes et Surfaces Elastiques en Analyse d'Images/
Deformable Models and Geodesic methods for Image Analysis

 Laurent D. Cohen   Directeur de Recherche au CNRS

Gabriel Peyré   Chargé de Recherche au CNRS
CEREMADE, UMR CNRS 7534,
Universite Paris IX Dauphine
Place du Marechal de Lattre de Tassigny
75775 Paris cedex 16, France
Tel. (33-1) 44 05 46 78 Fax (33-1) 44 05 45 99
Cohen, peyre @ ceremade.dauphine .fr
http://www.ceremade.dauphine.fr/~cohen

 Resume du Cours de Master


Marie-Curie PhD Fellowship

Propositions theses et Stages Stage Imagerie Biologique Stage Anisotropie
Proposition Stage Segmentation avec a priori de forme
Proposition de These CIFRE

Un support de cours est distribué pendant les cours. Les articles indiques ci-dessous permettent d'approfondir les notions vues en cours, mais il n'est évidemment pas obligatoire de lire tous ces articles.

Page de description et sources pour les TP: Numerical Tour


Plan du Cours (l'appariement thème/dates est approximatif et l'ordre peut aussi changer).

o    15 Janvier 2015 a 14h: Presentation du plan du cours si besoin.

o    15 Janvier 2015 14h-17h: Modeles Deformables

Reconstruction avec Régularisation. Contours Actifs. Modele de Ballon. Etc..
Article de synthese sur les modeles deformables

Article sur les contours actifs 2D et 3D: Differences Finies/Elements Finis/Ballon
Article sur les contours actifs et Region

o    22 Janvier 2015 14h-17h : La methode des Level Sets/Ensembles de Niveau
Methode des elements finis, Spline Snakes.

Modele de Ballon.
Evolution des courbes planes et methode des ensembles de niveau/ level sets.

o    29 Janvier 2015 14h-17h: Complements sur les modèles déformables
Modeles Deformables par level sets, Contours actifs Geodesiques.
Segmentation et Reconstruction avec Régularisation par level sets.
Methode de Blake et Zisserman Modele Region. Energie Chan Vese.
Contours Actifs Non Locaux

Modeles Deformables Parametriques, cad avec connaissance de forme a priori
Article de synthese sur les modeles deformables
Multiple rectangle model for Buildings Segmentation and 3D Scene Reconstruction
  Similar paper in French
Modeles Actifs de Forme et d'apparence (Cootes-Taylor)
Contrainte de Forme pour les level sets
Contrainte de Forme avec Apprentissage pour les level sets (Tsai-Yezzi etal)

o    5 Février 2015 14h-17h: Chemins Minimaux /lignes geodesiques
Article de synthese sur les chemins minimaux

Article de base sur les chemins minimaux
Article sur les chemins minimaux et l'endoscopie virtuelle

o    12 Fevrier 2015 14h-17h: cours-TP sur Analyse géodésique d'images et de surfaces

Métriques isotropes et anisotropes. Fast marching sur des triangulations. Application au maillages d'images et de surfaces. TP "Fast Marching in 2D" http://www.ceremade.dauphine.fr/~peyre/numerical-tour/tours/fastmarching_2d/
Geodesic re-meshing and parameterization using front propagation
Similar paper in French Landmark-based Computation for Heuristically Driven Path Planning.

o    19 Février 2015 14h-17h: Chemins Minimaux, Fast Marching et Voronoi
Multiple contour finding and perceptual grouping using minimal paths
Multiple Contour Finding and Perceptual Grouping as a set of Energy Minimizing Paths  Similar paper in French for RFIA'02
Fast extraction of tubular and tree 3D surfaces with front propagation methods. 
Fast Constrained Surface Extraction by Minimal Paths Similar paper in French for RFIA04

A new implicit method for surface segmentation by minimal paths in 3D images.

Fast 3D Brain Segmentation Using Dual-front Active Contours With Optional User-Interaction
Generalized Voronoi Tesselations for Vector-Valued Image Segmentation Similar paper in French

o    5 Mars 2015 14h-17h: TP Analyse différentielle de surfaces
Maillage de surfaces 3D, Opérateur différentiels sur des surfaces, EDP, Traitement de surface : lissage, compression
TP : Fast Marching sur des surfaces triangulées.
Notes de cours sur les maillages 3D: Numerical Mesh Processing

o    12 Mars 2015 14h-17h: Chemins Minimaux, Fast Marching et Vote Geodesique– suite
Chemins minimaux multiples : methode des Keypoints
Chemins minimaux et tubular Anisotropy
Chemins minimaux et Vote Geodesique
Chemins minimaux et Vote Geodesique suite
Chemins minimaux Livre de synthese

o    19 Mars 2015 14h-17h: cours-TP sur Méthodes level sets pour la segmentation d'images.
Représentation par level sets. Flot de courbure moyenne. Segmentation par contours actifs basés contour. Segmentation par contours actifs basés region.
TP : "Active Contours using Level Sets"
http://www.ceremade.dauphine.fr/~peyre/numerical-tour/tours/variational_segmentation/

 

 

Autres Articles sur ma page web

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VALIDATION du cours

En plus du projet, un petit examen écrit (QCM de 10 minutes) est prevu a l'issue du dernier cours.

La presence a ce QCM sera necessaire.

Veuillez remplir ce formulaire des maintenant pour me le remettre le jour de l'examen.

La derniere page peut etre anonyme si vous le desirez.

 


Un projet consistera en une etude approfondie d'un article accompagnee d'une mise en oeuvre numerique. Le travail a produire est le suivant:

·         lire le ou les article(s) propose(s).

·         implanter l'algorithme (ou une version simplifiee, ou une partie, selon l'article) et une demonstration (peu importe le langage, C++, MATLAB, SciLab, etc)

·         rediger un rapport (max ~10 pages, format final pdf) qui detaille votre comprehension de la methode, votre approche pour l'implanter et vos experimentations. la premiere page donnera les reponses aux 6 questions de ce document.

·         preparer une presentation (transparents ppt ou pdf) de 15 minutes. La date des soutenances sera debut avril.

Voici quelques sujets de projets proposes les années precedentes:

P1. Active Geodesics: Region based Active Contour Segmentation with a Global Edge based Constraint (PDF)

Vikram Appia (Georgia Tech), Anthony Yezzi (Georgia Institute of Technology)


P2. Automated Reconstruction of Tree Structures using Path Classifiers and Mixed Integer Programming

Engin Turetken, Fethallah Benmansour, Pascal Fua (PDF)


P3. Geodesics in Heat (PDF)


P4. Superpixel segmentation through geodesics (PDF)


P5. Means of Shapes (PDF)


P6. The Polygonal Path image (PDF) On comparera avec le geodesic Voting vu en cours.


P7. Deformable Shape Matching (PDF)


P8-Fully Isotropic Fast Marching (Appia et Yezzi) Second-order models for Computing Distance Transforms (S. and A. Yezzi)


 

P9-A Fast Level-set Approach to Surface Modeling from Unorganized Sample Points (M. Marcon, L. Picarreta, A. Sarti and S. Tubaro)


 

P10 segmentation of elongated structures