Sophie Donnet

    

Maître de conférences à l’Université Paris-Dauphine.

Membre du CEREMADE, UMR CNRS 7534.

E-mail : donnet (arobas) ceremade.dauphine.fr



 

Situation Actuelle
En délégation CNRS pour l’année 2012-2013.

Chercheuse invitée au CIMAT (Centro de Investigacion en Matematicas, C.A) et à l’Instituto de Matematicas 

de la Universidad Nacional Autonoma de México (UNAM), Unidad de Juriquilla.  Mexique.

 

     Thèmes de recherche

* Algorithmes stochastiques: MCMC, EM et versions stochastiques, filtres particulaires, ABC (Approximate Bayesian Computation)

* Modèles définis par équations différentielles ordinaires et stochastiques.

*Statistiques bayésiennes: élicitation de loi a priori et combinaison de dires d'experts

* Statistiques bayésiennes  paramétriques et non paramétriques pour processus de comptage.  

*Inférence statistique pour les modèles graphiques gaussiens  et  pour les réseaux  multi-niveaux.

*Applications: neurosciences, pharmacocinétique, risque alimentaire, fiabilité EDF,  réseaux sociaux

Dauphine insolite by S. DonnetDauphine Insolite



Cimat, Guanajuato

Curriculum Vitae (.pdf)

*     2007-        :  Maître de conférences à l'Université Paris-Dauphine. CEREMADE

*     2006-2007 :  ATER à l'Université Paris-Descarte

*   2003-2006 :  Monitrice à l’IUT de Sceaux, Université Paris-11

*   2003-2006  : Prépartion du doctorat  au laboratoire de mathématiques, Université Paris-11 (Orsay)


Directeurs de thèse : Marc Lavielle et Jean-Baptiste Poline.

Titre : Inversion de données IRMf. Estimation et sélection de modèles.                   

                  





 

   Publications

[A7] I. Albert, S. Donnet, C. Guihenneuc, S. Low-Choy, K. Mengersen, J. Rousseau, Combining expert opinions in prior elicitation (with discussion). Bayesian Analysis, 7(3), 503-546 (2012)

[A6] S. Donnet, J.-M. Marin . An empirical Bayes procedure for the selection of Gaussian graphical models. Statistics and Computing, 22(5), 1113-1123 (2012)

[A5] S. Donnet , J-L Foulley, A. Samson. Bayesian analysis of growth curves using mixed models defined by stochastic differential equations . Biometrics, 66(3),733-741, (2010)

[A4] P. Ciuciu, T. Vincent, L. Risser, S. Donnet. A joint detection-estimation framework for analysing within- subject fMRI data. Journal de la Société Française de Statistiques, Vol. 151, No 1 (2010)

[A3] S. Donnet, A. Samson. Parametric inference for mixed models defined by stochastic differential equations. ESAIM P&S, 12 :196-218, (2008)

[A2] S. Donnet, A. Samson. Estimation of parameters in missing data models defined by differential equations. J. Statist. Plann. Inference 137 (2007), no. 9, 2815–2831

[A1] S. Donnet, M. Lavielle, and J.-B. Poline. Are fMRI event related reponses constant across events ?. Neuroimage,Volume 31, Issue 3, 1 (July 2006), 1169 – 1176


     Preprints

[S1] S. Donnet, J. Rousseau. Bayesian estimation in a partially observed branching process. Supplementary material

[S2] S. Donnet, A. Samson. EM algorithm coupled with particle filter for maximum likelihood parameter estimation of stochastic differential mixed-effects models.

[S3] S. Donnet, A. Samson. A review on estimation of stochastic differential equations for pharmacokinetic/pharmacodynamic models. Minor revision dans  Advanced Drug Delivery Reviews

Revues de livres et discussions

– S. Donnet. Book review of “Stochastic Modelling for Systems Biology (second edition)” by Darren J. Wilkin- son. CHANCE 25-4 (Décembre 2012)

– S. Donnet. Book review of “Statistical Thinking in Epidemiology” by Yu-Kang Tu and Mark S. Gilthorpe. CHANCE 25-4 (Décembre 2012)

– S. Donnet. Book review of “Monte Carlo Simulation for the Pharmaceutical Industry : Concepts, Algorithms, and Case Studies” by Mark Chang. International Statistical Review (Avril 2012)

– S. Donnet, A. Samson. Discussion on “Parameter estimation for differential equations : a generalized smoothing approach” (by Ramsay J.O., Hooker G., Campbell D. and Cao, J.), Journal of the Royal Statistical Society : Series B, 69(5) :741-796, (2007)

       Projets de recherche

* 2012 :  ANR Calibration sur Calibration de procédures statistiques complexes. Coordinateur : V. Rivoirard

*2011 :  ANR Bandhit sur Statistiques bayésiennes non-paramétriques. Coordinateur : J. Rousseau

*2012 :  PEPS Estimation de graphes de dépendance entre neurones thalamiques et cortico-thalamiques via des modèles de Hawkes multivariés. Coordinateur: P. Reynaud-Bouret

*2009 - 2012  :  ANR BigMC sur Méthodes de Monte Carlo en grande dimension. Coordinateur : G. Fort

*2004 - 2007  :  ANR Monolix sur Modèles non-linéaires à effets mixtes. Coordinateur : M. Lavielle



Eglise de la Valenciana. Guanajuato. Mexique

   Collaborations

*  Internationales :   Sama Low-Choy  et   Kerrie Mengersen (QUT, Bribane, Australie), J. Andres Christen  et  Marcos A. Capistran (CIMAT, Mexique), Hugo Merchant (Instituto de Neurobiologia,  Juriquilla, Mexique)

*  Nationales :  Isabelle Albert (INRA), Avner Bar-Hen (MAP5), Pierre Barbillon (Agro Paris-Tech), Philippe Ciuciu (NeuroSpin), Chantal Guihenneuc (Paris-Descartes),  Jean-Louis Foulley (INRA), Emmanuel Lazega (Science - Po), Jean-Michel Marin (Montpellier), Vincent Rivoirard (CEREMADE), Judith Rousseau (CREST-CEREMADE), Adeline Samson (MAP5)



      Activités d'enseignement

 

Depuis  2007 à l'Université Paris-Dauphine :

* Statistiques-1 L1 (DUGEAD). Cours-TD. Corresponsabilité de cet enseignement avec Katia Meziani 2011-2012. 

* Statistiques-2 L2 (DUGEAD). Cours-TD. Corresponsabilité de cet enseignement avec Claudine Dhuin de septembre 2009 à juillet 2011. 

* Statistiques L2 (MI2E). TD

* Statisiques exploratoires L3 (MI2E).  TD-TP. Cours de Christian P. Robert

* Statistiques mathématiques L3  (MI2E). TD

* Modèle linéaire généralisé (M1 MIDO). TD. Cours de Katia Meziani

* Statistiques non-paramétriques (M1 MIDO). TD. Cours de Vincent Rivoirard

* Etude de cas Bayésien (M2 TSI). Cours

Année scolaire 2006-2007

* Travaux Dirigés et Travaux  Pratiques en Licence mention "Mathématiques Informatique et Applications (MIA)" en 1ère  et 2ème années:

* Mathématiques et Calcul. Enseignant responsable: Christine Graffigne.

* Probabilités.  Enseignant responsable: Valentine Genon-Catalot.

* Probabilités et initiation au logiciel R.   Enseignant responsable:  Thierry Cabanal-Duvillard .

* Introduction aux statistiques (TD et TP). Enseignant responsable: Antoine Chambaz

* Environnement de calcul scientifique et Modélisation (logiciel Scilab). Enseignant responsable:  Georges Koepfler.


Années scolaires 2003-2006 : monitorat

Département Techniques de Commercialisation 1:   Calcul algébrique, statistique descriptive, séries chronologiques, probabilités.  Enseignants responsables:  Arnaud Le Ny et Sara Brofferio.

Encadrement d'un club  Maths en Jeans au lycée Sainte-Marie (Antony 92)